代謝體(metabolome)為細胞、組織、體液或器官所含的小分子的集合，代謝體的研究稱為代謝體學(metabolomics)。應用代謝物進行臨床診斷並非一項新概念，如應用於新生兒健康篩檢的新生兒代謝異常疾病即是分析新生兒代謝物。傳統的單一代謝物檢驗和代謝體的研究差別第一在於數量級，人體代謝分子中含有成仟上百的小分子化合物，如何從這麼多的化合物中擷取對生理病理有影響的分子標的及合理的生物指標(biomarker)，要有良好的分析實驗設計更要有嚴謹的統計及生物資訊方法，及配合系統生物學研究(systems biology)方法建構生物網絡。代謝體最強大的功用在於其對生理病理的機轉能有一個全面的網路分析，所找到的生物指標可成為診斷、癒後指標及藥物開發的標的。代謝體是結合生物化學、儀器分析、生物統計、生物資訊學及系統生物學等多項領域的學門。